及时篇 概述

第1章 介绍：什么是基因表达？

1.1 分子生物学的中心法则

1.2 基因转录的复杂性

1.3 转录调控元件

1.4 染色质活动在基因调控中的作用

1.5 基因表达程序

1.6 主要概念

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第2章 染色质的功能

2.1 常染色质和异染色质

2.2 核小体

2.3 染色质开放和封闭时的组蛋白修饰

2.4 组蛋白修饰的基因组效应

2.5 染色质结构

2.6 表观遗传信号对健康和疾病的影响

2.7 主要概念

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第二篇 转录因子篇

第3章 基础转录机器

3.1 核心启动子

3.2 TATA框

3.3 核心启动子元件

3.4 TFⅡD作为多蛋白复合物的范例

3.5 基因组范围内识别核心启动子的方法

3.6 中介复合物

3.7 主要概念

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第4章 转录因子

4.1 位点特异性转录因子

4.2 转录因子结构域

4.3 二聚体化的转录因子复合物：核受体异源二聚体的例子

4.4 生物信息学方法识别转录因子结合位点

4.5 转录因子表达谱

4.6 转录因子的分类

4.7 主要概念

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第5章 信号转导与基因调控

5.1 潜在转录因子的激活

5.2 转录因子网络

5.3 转录因子调控的程序性细胞分化

5.4 NFKB信号途径

5.5 炎症反应中的转录因子

5.6 感应细胞压力：p53途径

5.7 主要概念

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第6章 基因表达开关：核受体的例子

6.1 核受体超家族

6.2 核受体的分子间相互作用

6.3 核受体的生理作用

6.4 核受体及其配体

6.5 核受体和辅因子的相互作用

6.6 主要概念

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第7章 基因组作图

7.1 进化足迹法

7.2 ENCODE计划

7.3 ENCODE计划的数据挖掘

7.4 整合ChIP-seq数据

7.5 转录因子的其他DNA结合模式

7.6 转录因子与靶基因的匹配

7.7 主要概念

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第三篇 染色质篇

第8章 染色质修饰因子

8.1 组蛋白密码模型

8.2 组蛋白修饰酶

8.3 组蛋白标记的全基因组分析和它们的修饰酶

8.4 染色质修饰和疾病

8.5 主要概念

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第9章 基因组印记

9.1 绝缘子

9.2 基因组调节CTCF

9.3 基因组印记

9.4 绝缘子功能模型

9.5 CTCF介导的染色质结构的遗传

9.6 主要概念

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第10章 表观基因组

10.1 DNA甲基化

10.2 基因组范围的DNA甲基化

10.3 DNA甲基化、异染色质和基因沉默

10.4 健康与疾病中的表观基因组学

10.5 主要概念

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第11章 染色质重塑

11.1 染色质重塑的作用

11.2 ATP-依赖的重塑复合物

11.3 启动子上的核小体定位

11.4 先锋因子

11.5 转录动力学和噪声

11.6 主要概念

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第12章 染色质结构

12.1 细胞核的组织

12.2 高级DNA环结构的形成

12.3 细胞核内的分区

12.4 转录工厂

12.5 核定位与疾病

12.6 主要概念

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第四篇 非编码RNA篇

第13章 调控RNA

13.1 非编码RNAs

13.2 miRNA及其功能

13.3 长链非编码RNA

13.4 eRNA

13.5 miRNA和转录因子介导的基因调控

13.6 主要概念

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